RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 DIAPH2O60879 1101 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 WEE2P0C1S8 567 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 PROZP22891 400 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 FSTL1Q12841 308 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF570Q96NI8 536 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 TLE6Q9H808 572 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 DONSONQ9NYP3 566 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD1-201ENST00000331462 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 B4GALT4O60513 344 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM63AO94886 807 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 APOC2P02655 101 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 EDNRBP24530 442 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 STAT5BP51692 787 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ACAP1Q15027 740 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 FAM167AQ96KS9 214 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TCHPQ9BT92 498 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ZWILCHQ9H900 591 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 HAO1Q9UJM8 370 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 E7ENQ6 273 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PRKCBP05771 671 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ADRA1DP25100 572 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 DYNLT1P63172 113 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PDIK1LQ8N165 341 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 BCO2Q9BYV7 579 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK6Q16659 721 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 XYLT1Q86Y38 959 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MICALL2Q8IY33 904 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CNTN2Q02246 1040 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 FAM13CQ8NE31 585 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PEX11AO75192 247 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TNNC2P02585 160 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CHSY1Q86X52 802 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TCP10LQ8TDR4 215 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CYTH2Q99418 400 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 GNAZP19086 355 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PSMC4P43686 418 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 KCNT1Q5JUK3 1230 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CPXM1Q96SM3 734 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MCF2LO15068 1137 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 SPAG6O75602 509 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 IL1BP01584 269 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CALB2P22676 271 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN4P29074 926 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 GABRB2P47870 512 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 RAD23BP54727 409 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.6■■□□□ 1.37
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