RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SATL1Q86VE3 508 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.2■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 BANF1O75531 89 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 KRT1P04264 644 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SERPINA6P08185 405 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CATSPER2Q96P56 530 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PEX1O43933 1283 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 IFNB1P01574 187 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 DBN1Q16643 649 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 MMEL1Q495T6 779 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CEP55Q53EZ4 464 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PDIK1LQ8N165 341 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PARVAQ9NVD7 372 aa20.19■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 STRNO43815 780 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 ZNF862O60290 1169 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 AOC1P19801 751 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SNAP25P60880 206 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PDK3Q15120 406 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SFT2D3Q587I9 215 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SLC51AQ86UW1 340 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CPT1BQ92523 772 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 A0A088AWK7 358 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 E5RJQ4 531 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 INHBAP08476 426 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 HPCAP84074 193 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 DEUP1Q05D60 604 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 MSS51Q4VC12 460 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SV2AQ7L0J3 742 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SERAC1Q96JX3 654 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SPAG6O75602 509 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CPOXP36551 454 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PLCB3Q01970 1234 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 APBB2Q92870 758 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 COPEO14579 308 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 NOMO3P69849 1222 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 C2CD6Q53TS8 623 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 RIT2Q99578 217 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NOP56-201ENST00000329276 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms