RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PKDCCQ504Y2 493 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 REXO1L1PQ8IX06 675 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR65Q8IYL9 337 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCOLN2Q8IZK6 566 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF653Q96CK0 615 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf70Q9BRQ4 267 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTUS1Q9ULD2 1270 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFR2Q9UP52 801 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1671Q9BY89 1806 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 USP27XA6NNY8 438 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 PJA2O43164 708 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP8P22894 467 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 BDNFP23560 247 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB2P25686 324 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF662Q6ZS27 426 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TDHQ8IZJ6 230 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP2Q9H0W7 228 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR17Q13304 367 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MON1BQ7L1V2 547 aa28.98■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STK32AQ8WU08 396 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.98■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STRIP2Q9ULQ0 834 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf67F2Z3F1 127 aa28.97■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CTSAP10619 480 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1D2P34982 312 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K7CLP57077 242 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE3AQ05086 875 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 C18orf8Q96DM3 657 aa28.97■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYTH4Q9UIA0 394 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GUCA1BQ9UMX6 200 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0U1RQJ8 604 aa28.96■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACADSBP45954 432 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G4AP47712 749 aa28.95■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.95■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HSFY1Q96LI6 401 aa28.95■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BTNL10A8MVZ5 291 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 TULP2O00295 520 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN14Q15678 1187 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4A22Q5TCH4 519 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2R2DQ66LE6 453 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSTM1Q6UX27 236 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28.94■■■□□ 2.22
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