RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RAXQ9Y2V3 346 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD18B2RXH4 712 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A4O15374 487 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPNS1P04632 268 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NFICP08651 508 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HDCP19113 662 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ITPKAP23677 461 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPLA4P41247 253 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIA2P42262 883 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF4P43489 277 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP3CCP48454 512 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL7Q01449 175 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 USP4Q13107 963 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RESTQ13127 1097 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PDIA5Q14554 519 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NBR1Q14596 966 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB6Q15916 424 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MDM1Q8TC05 714 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM32Q8TC27 787 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 FNBP1Q96RU3 617 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB7Q9H672 318 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN10Q9HC96 672 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KCND2Q9NZV8 630 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WV48 116 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 LACTBL1A8MY62 500 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EQS6 105 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ABLIM1O14639 778 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 OGTO15294 1046 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BP5O60239 455 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PFKFB2O60825 505 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL4O94818 638 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KAT7O95251 611 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CER1O95813 267 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PLS3P13797 630 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CD59P13987 128 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GUCY2CP25092 1073 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG1Q07617 926 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 E2F5Q15329 346 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SEZ6Q53EL9 994 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GLRX5Q86SX6 157 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ALLCQ8N6M5 410 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF25Q93038 417 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MYRFLQ96LU7 910 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 C2CD2Q9Y426 696 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FRYQ5TBA9 3013 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KPNA7A9QM74 516 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PIRO00625 290 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 HUS1O60921 280 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF883P0CG24 379 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA13P27216 316 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK1P29120 753 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC10P48553 1259 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 INAVAQ3KP66 663 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.45□□□□□ -1.06
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