RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTP4A2Q12974 167 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PKDCCQ504Y2 493 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TEX35Q5T0J7 233 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MON1BQ7L1V2 547 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LHX5Q9H2C1 402 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCK2O43639 380 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BEST1O76090 585 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF15O94989 841 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OAZ2O95190 189 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAG3P18627 525 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCSK1P29120 753 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CACNA2D1P54289 1103 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FIBCD1Q8N539 461 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD9AQ99638 391 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAMA3Q16787 3333 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP290O15078 2479 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FTCDO95954 541 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RGS7P49802 495 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDE4CQ08493 712 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEAL1Q15170 157 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYLPFQ96A32 169 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF653Q96CK0 615 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPXM1Q96SM3 734 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF185O15231 689 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM171BQ6P995 826 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYCE1Q8N0S2 351 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA18Q8TC71 538 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MED10Q9BTT4 135 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP83Q9Y592 693 aa25.21■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GBF1Q92538 1859 aa25.2■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C2CD2LO14523 706 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GJB6O95452 261 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMP8P22894 467 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRM1P23921 792 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPC5P78333 572 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTXN3Q4LDR2 81 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PMF1Q6P1K2 205 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CREG2Q8IUH2 290 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RHOT2Q8IXI1 618 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTPALQ9BTX7 342 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPG21Q9NZD8 308 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COG5Q9UP83 839 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GABBR2O75899 941 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HADHBP55084 474 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDCLQ13371 301 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STILQ15468 1287 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM35AQ86V20 835 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COG1Q8WTW3 980 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM169Q96HH4 297 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HESX1Q9UBX0 185 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERBB2P04626 1255 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARPP19P56211 112 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERICH1Q86X53 443 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ST7Q9NRC1 585 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT82Q9NSB4 513 aa25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAM12O43184 909 aa25.18■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.18■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.17■■□□□ 1.62
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