RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Setd3Q91WC0 594 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpt1bQ924X2 772 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tex9Q9D845 387 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sbno2Q7TNB8 1349 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Svs3aF2Z472 265 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Elk3P41971 409 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d10aP58802 500 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc9Q3V038 219 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Svs3bQ8BZH8 265 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Uba3Q8C878 462 aa23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CiitaP79621 1155 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irf6P97431 467 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grm6Q5NCH9 871 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rgl2Q61193 778 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhh3Q8VCE9 796 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdhb1Q91Y08 818 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmed5Q9CXE7 229 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc73B2RWC4 316 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lhx5P61375 402 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GclcP97494 637 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abhd15Q5F2F2 459 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam214aQ69ZK7 1075 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smg5Q6ZPY2 1017 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr385Q8VGT1 312 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr3cQ9D483 533 aa23.09■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Robo3Q9Z2I4 1366 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm44503E9PYU5 387 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Per2O54943 1257 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NyxP83503 476 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ugt1a1Q63886 535 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Parp6Q6P6P7 630 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kctd12bQ8C7J6 292 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp33Q8R5K2 909 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsrc1Q9DBU6 334 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Piwil1Q9JMB7 862 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pck1Q9Z2V4 622 aa23.08■■□□□ 1.29
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r59E9PUT5 865 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vti1aO89116 217 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vav1P27870 845 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mxi1P50540 228 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rcsd1Q3UZA1 412 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LbpQ61805 481 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GnasQ6R0H7 1133 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gabbr2Q80T41 940 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ints6lQ8BND4 861 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdik1lQ8QZR7 341 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adi1Q99JT9 179 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hes6Q9JHE6 224 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tk2Q9R088 270 aa23.08■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cops5O35864 334 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il3P01586 166 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gjb1P28230 283 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnl1P36916 607 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npas2P97460 816 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab34Q64008 259 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpm4Q7TN37 1213 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fut2Q9JL27 347 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1305A2AVW3 312 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh5E9PUJ8 762 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nek2O35942 443 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irf3P70671 419 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spata24Q6P926 205 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kctd15Q8K0E1 283 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dpp3Q99KK7 738 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mbd1Q9Z2E2 636 aa23.07■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc13D3YV10 709 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zc3h12bG3X9I7 835 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdcd2P46718 343 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shmt1P50431 478 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf746Q3U133 652 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trappc3lQ4KL14 181 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FcgrtQ61559 365 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbl2Q64700 1135 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ripor1Q68FE6 1223 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam102aQ78T81 392 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Med7Q9CZB6 233 aa23.06■■□□□ 1.28
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rmi1Q9D4G9 616 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.8 ms