RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620182.4

CPEB1-218, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPEB1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-218ENST00000620182 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 M0QYV0 167 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 MAGEA9P43362 315 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 ACAP1Q15027 740 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 KYNUQ16719 465 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 GPR142Q7Z601 462 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 MDM1Q8TC05 714 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC77Q9BR77 488 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 MIS12Q9H081 205 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 DPP3Q9NY33 737 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.27■■□□□ 1.16
CPEB1-218ENST00000620182 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 LRCH4O75427 683 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TCEA3O75764 348 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 MMP3P08254 477 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 GABRB2P47870 512 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PPARDQ03181 441 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ORC1Q13415 861 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 DGKDQ16760 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 LONRF1Q17RB8 773 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TTC13Q8NBP0 860 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TRIM66O15016 1216 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ERBB2P04626 1255 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ITGAVP06756 1048 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 GRM5P41594 1212 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 INCA1Q0VD86 236 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 GRB14Q14449 540 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.26■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PLXNB2O15031 1838 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 SMPD1P17405 629 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ARSEP51690 589 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 MAML3Q96JK9 1138 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ZWILCHQ9H900 591 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 EVPLQ92817 2033 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 C5orf60A6NFR6 353 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 RNF8O76064 485 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 GPD2P43304 727 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 CDC42EP1Q00587 391 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 KIF12Q96FN5 646 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.25■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PLCB3Q01970 1234 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 MYO1EQ12965 1108 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ACVR2BQ13705 512 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 STILQ15468 1287 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PTPN18Q99952 460 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TINF2Q9BSI4 451 aa22.24■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 STAT4Q14765 748 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PPM1EQ8WY54 764 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 DERAQ9Y315 318 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 NDST1P52848 882 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 MORF4L2Q15014 288 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 RGMBQ6NW40 437 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.23■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 ABHD2P08910 425 aa22.22■■□□□ 1.15
CPEB1-218ENST00000620182 KDELR1P24390 212 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms