RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CSH1	P0DML2	217 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CSH2	P0DML3	217 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC192	P0DO97	292 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DDIT3	P35638	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	GALK1	P51570	392 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	MTF1	Q14872	753 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	LOXL4	Q96JB6	756 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	IGF2R	P11717	2491 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	DCLK1	O15075	740 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PML	P29590	882 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MPL	P40238	635 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PNPLA4	P41247	253 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PDGFRL	Q15198	375 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPA	Q15257	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PLK5	Q496M5	336 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	STPG1	Q5TH74	334 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC16	Q8NEE8	873 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MYRFL	Q96LU7	910 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ACBD6	Q9BR61	282 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ECT2	Q9H8V3	914 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CLIC4	Q9Y696	253 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ZZEF1	O43149	2961 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	THADA	Q6YHU6	1953 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf78	A6NCI8	922 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SOBP	A7XYQ1	873 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG13	O75143	517 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP3	O75969	853 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CKM	P06732	381 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	DRD1	P21728	446 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	POSTN	Q15063	836 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	EML3	Q32P44	896 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CPA6	Q8N4T0	437 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CLIC6	Q96NY7	704 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GCNT4	Q9P109	453 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	STK17A	Q9UEE5	414 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP13	Q12802	2813 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SPEG	Q15772	3267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087X0B3	334 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRD	O14764	452 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	HUS1	O60921	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP2C2	O75185	946 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GCNT3	O95395	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ZXDB	P98169	803 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MYL7	Q01449	175 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	DMC1	Q14565	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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