RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 PKMYT1Q99640 499 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 STK17AQ9UEE5 414 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 L1RE1Q9UN81 338 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 HUS1O60921 280 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP2F1P24903 491 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MYL7Q01449 175 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 USP4Q13107 963 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MTF1Q14872 753 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF77Q15935 545 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DDR2Q16832 855 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 USP49Q70CQ1 688 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CPA6Q8N4T0 437 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CXorf38Q8TB03 319 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA18Q8TC71 538 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOC4Q96A65 974 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SAAL1Q96ER3 474 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 HHIPQ96QV1 700 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM206Q9H813 350 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ECT2Q9H8V3 914 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MYMKA6NI61 221 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GABRDO14764 452 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GCNT3O95395 438 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GAP43P17677 238 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GARTP22102 1010 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PMLP29590 882 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MPLP40238 635 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP5P51878 434 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC142Q17RM4 750 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PLK5Q496M5 336 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 STPG1Q5TH74 334 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT13Q7L8C5 426 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 OSTM1Q86WC4 334 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CD101Q93033 1021 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP2A3Q93084 1043 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM84AQ96KN4 292 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ACCSQ96QU6 501 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A12Q96S37 553 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS45Q9NRW7 570 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SIX4Q9UIU6 781 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRDP23468 1912 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 HCRTO43612 131 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 APBB3O95704 486 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CKMP06732 381 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT19P08727 400 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 USP17L7P0C7H9 530 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF3P15923 654 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PCSK1P29120 753 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNAR2P48551 515 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 LHX1P48742 406 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ALCAMQ13740 583 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DMC1Q14565 340 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EML3Q32P44 896 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms