RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PRMT2P55345 433 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 FAM26DQ5JW98 314 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ACOT1Q86TX2 421 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PTGESO14684 152 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ACLYP53396 1101 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 LILRA4P59901 499 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PKDCCQ504Y2 493 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ODF2Q5BJF6 829 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ALS2CLQ60I27 953 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 JAMLQ86YT9 394 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 UBA3Q8TBC4 463 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SLCO2A1Q92959 643 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TNIP3Q96KP6 325 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.63■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 F8VP50 259 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 THP07101 528 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 KRT7P08729 469 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SKIP12755 728 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 OGDHQ02218 1023 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 DUPD1Q68J44 220 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 C12orf29Q8N999 325 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ST7Q9NRC1 585 aa23.62■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PTPN7P35236 360 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PTGIRP43119 386 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 LRRC45Q96CN5 670 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 CYLDQ9NQC7 956 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PADI3Q9ULW8 664 aa23.61■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SPTLC1O15269 473 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 DAPK3O43293 454 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 RNF8O76064 485 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ECEL1O95672 775 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PFKMP08237 780 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 RALAP11233 206 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TMEM110Q86TL2 294 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 FAM71BQ8TC56 605 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PGBD4Q96DM1 585 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.6■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TJP3O95049 919 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 PAX3P23760 479 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ECHS1P30084 290 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 MLH1P40692 756 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 BCAT1P54687 386 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 CCNG2Q16589 344 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ZFP42Q96MM3 310 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 RNF19AQ9NV58 838 aa23.59■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 E5RJQ4 531 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 HSF2BPO75031 334 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 KRT1P04264 644 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 DESP17661 470 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 CD52P31358 61 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 DSC3Q14574 896 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TRADDQ15628 312 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-218ENST00000590546 TTC27Q6P3X3 843 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms