RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 SYT15Q9BQS2 421 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 OBP2AQ9NY56 170 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1B0GVL5 298 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 PFKFB1P16118 471 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 LMO2P25791 158 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 WEE1P30291 646 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
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PPP4C-212ENST00000567828 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 DPH6Q7L8W6 267 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 PAGE5Q96GU1 130 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 MMS19Q96T76 1030 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP4C-212ENST00000567828 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TXNDC8Q6A555 127 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TSSK4Q6SA08 328 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA32Q96LK8 384 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CHRDQ9H2X0 955 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 EXOC1Q9NV70 894 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CCL26Q9Y258 94 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TADA3O75528 432 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 NOL4O94818 638 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 PDGFRBP09619 1106 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 AVPR1AP37288 418 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TNK2Q07912 1038 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 STK4Q13043 487 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 FAM171BQ6P995 826 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF516Q92618 1163 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MYLPFQ96A32 169 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CDH9Q9ULB4 789 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 GPR179Q6PRD1 2367 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 EXOC3O60645 756 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CMA1P23946 247 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CASP4P49662 377 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 KRT85P78386 507 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MSANTD3Q96H12 275 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 KINO60870 393 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CHRNB1P11230 501 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CTHP32929 405 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 WDR44Q5JSH3 913 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 HPSEQ9Y251 543 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 NME7Q9Y5B8 376 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 BDNFP23560 247 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MAGEA11P43364 429 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MYL6P60660 151 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TNNC1P63316 161 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 PLCB2Q00722 1185 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 CYP27A1Q02318 531 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 RIN3Q8TB24 985 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MYRFLQ96LU7 910 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 SNX25Q9H3E2 840 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TDP1Q9NUW8 608 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 USP25Q9UHP3 1055 aa24.28■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 PSMD2Q13200 908 aa24.27■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 TRPC3Q13507 836 aa24.27■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 GAS6Q14393 721 aa24.27■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 PON2Q15165 354 aa24.27■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.27■■□□□ 1.48
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.27■■□□□ 1.48
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