RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564228.5

TCF4-222, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-222	ENST00000564228	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SCNN1B	P51168	640 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	FCGRT	P55899	365 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RTP1	P59025	263 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TTLL4	Q14679	1199 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	COPS5	Q92905	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SNF8	Q96H20	258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	THAP12	O43422	761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	MTA2	O94776	668 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ASL	P04424	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RGS2	P41220	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	PSMC5	P62195	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	DSG1	Q02413	1049 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	PTK6	Q13882	451 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CCL14	Q16627	93 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RDM1	Q8NG50	284 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	MAML1	Q92585	1016 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CENPF	P49454	3210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RASA4B	C9J798	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	PDXK	O00764	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RASA4	O43374	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	EXOC3	O60645	756 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CYP11B2	P19099	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CRABP2	P29373	138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	INHBC	P55103	352 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	USP46	P62068	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	METTL7B	Q6UX53	244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	APBA2	Q99767	749 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	COG5	Q9UP83	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	DNAJC6	O75061	913 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ATP6V1G1	O75348	118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	SP3	Q02447	781 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	KYNU	Q16719	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-222	ENST00000564228	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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