RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 LRRN2O75325 713 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 HLA-DRAP01903 254 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 FAM163BP0C2L3 166 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 PCED1BQ96HM7 432 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TADA3O75528 432 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 F11P03951 625 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 BDNFP23560 247 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MAGEA11P43364 429 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CLCN5P51795 746 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 NLRP12P59046 1061 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 GPR158Q5T848 1215 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 F5P12259 2224 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 NOL4O94818 638 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 PRAMEF12O95522 483 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 FGF19O95750 216 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 AOC1P19801 751 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 PIK3CAP42336 1068 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ASPAP45381 313 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CACNA2D1P54289 1103 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ENPEPQ07075 957 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 GPR88Q9GZN0 384 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 KCNH6Q9H252 994 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 SHISA7A6NL88 538 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 A8MXQ7 604 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CSH1P0DML2 217 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CSH2P0DML3 217 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 KRT13P13646 458 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CDC25CP30307 473 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CYP27A1Q02318 531 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TCF15Q12870 199 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TAF12Q16514 161 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MYRFLQ96LU7 910 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 TASP1Q9H6P5 420 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-222ENST00000550996 CLDN5O00501 218 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CETN3O15182 167 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PLA2G5P39877 138 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MORC3Q14149 939 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 VSTM1Q6UX27 236 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TAF4BQ92750 862 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 SEMA4DQ92854 862 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 FOXQ1Q9C009 403 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 ARNTLO00327 626 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 BIN1O00499 593 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CLSTN1O94985 981 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PSMC3P17980 439 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 STARD6P59095 220 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 USP46P62068 366 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 UBE2HP62256 183 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 ORC1Q13415 861 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GCNAQ96QF7 691 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TSG101Q99816 390 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 BCO2Q9BYV7 579 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DMDP11532 3685 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 F8VP50 259 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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