RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ANK1	P16157	1881 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TSC2	P49815	1807 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SGK1	O00141	431 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	NFIC	P08651	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ODC1	P11926	461 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A11	P48066	632 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	AMPD2	Q01433	879 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	LMAN2	Q12907	356 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	DDR2	Q16832	855 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SCN1A	P35498	2009 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CYB561D2	O14569	222 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	USP4	Q13107	963 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TAF12	Q16514	161 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MDM1	Q8TC05	714 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	OBSL1	O75147	1896 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM23	O75077	832 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PLS3	P13797	630 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	STRN3	Q13033	797 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	HCRT	O43612	131 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SH3BP5	O60239	455 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	NOL4	O94818	638 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CFI	P05156	583 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CYP2F1	P24903	491 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	IFNAR2	P48551	515 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PDIA5	Q14554	519 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31

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