RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524719.1

TSTA3-202, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-202ENST00000524719 PSMG2Q969U7 264 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 HPDLQ96IR7 371 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 COL4A2P08572 1712 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 A0A1W2PRU2 124 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CLSTN1O94985 981 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 KIF20AO95235 890 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 FGF19O95750 216 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ATF6P18850 670 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TGM1P22735 817 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CCNE1P24864 410 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 LHX1P48742 406 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CCR3P51677 355 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 SATB1Q01826 763 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TAF12Q16514 161 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 YAF2Q8IY57 180 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GCNAQ96QF7 691 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ACBD6Q9BR61 282 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 IER2Q9BTL4 223 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 LRRC3Q9BY71 257 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GPR88Q9GZN0 384 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 NCANO14594 1321 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ZNF202O95125 648 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CHRNB1P11230 501 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GABRR2P28476 465 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 PCSK1P29120 753 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CXCL12P48061 93 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 SPEM2Q0P670 501 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 DPYDQ12882 1025 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TRPC3Q13507 836 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 DPH6Q7L8W6 267 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 OSTM1Q86WC4 334 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 PDXKO00764 312 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 RHOBTB3O94955 611 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 NR3C1P04150 777 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CDC25CP30307 473 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 SOX9P48436 509 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 TNNC1P63316 161 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 GIPC2Q8TF65 315 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 E2F7Q96AV8 911 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 MMS19Q96T76 1030 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 RTKNQ9BST9 563 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-202ENST00000524719 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 ARNTLO00327 626 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 GABRDO14764 452 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 HCRTO43612 131 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 PHACTR2O75167 634 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 FNTBP49356 437 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 CASP4P49662 377 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 DMWDQ09019 674 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 BIRC3Q13489 604 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 GAS6Q14393 721 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 GAREM2Q75VX8 874 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 PKMYT1Q99640 499 aa14.83□□□□□ -0.04
TSTA3-202ENST00000524719 SYT15Q9BQS2 421 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms