RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523155.1

IGKV3-25-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3-25 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV3-25, Length 253 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-25-201ENST00000523155 ATICP31939 592 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAGEA9P43362 315 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAGEA11P43364 429 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CASP4P49662 377 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MYL6P60660 151 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 SDHAF4Q5VUM1 108 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CEP135Q66GS9 1140 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FAM171BQ6P995 826 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 YAF2Q8IY57 180 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 STKLD1Q8NE28 680 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ZNF516Q92618 1163 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ARNTLO00327 626 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAPK13O15264 365 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CHADO15335 359 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ATP2C2O75185 946 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 LRRN2O75325 713 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TADA3O75528 432 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 F11P03951 625 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FAM163BP0C2L3 166 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 GLULP15104 373 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NR2F2P24468 414 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 LMO2P25791 158 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NBL1P41271 181 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NLRP12P59046 1061 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CLDN10P78369 228 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NCOA4Q13772 614 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NFIL3Q16649 462 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 DDR2Q16832 855 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 VSTM1Q6UX27 236 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TMC2Q8TDI7 906 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MSANTD3Q96H12 275 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 BCO2Q9BYV7 579 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.51□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FAM170BA6NMN3 283 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 SOBPA7XYQ1 873 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 A8MXQ7 604 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 PROB1E7EW31 1015 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAN2B1O00754 1011 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 TRIM66O15016 1216 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 NCAM2O15394 837 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 VNN1O95497 513 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 PDGFRBP09619 1106 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 P4HA1P13674 534 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CD72P21854 359 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 BDNFP23560 247 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ANXA13P27216 316 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 AVPR1AP37288 418 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 PIK3CAP42336 1068 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 VAMP7P51809 220 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 DLG4P78352 724 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CYP27A1Q02318 531 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 PNOCQ13519 176 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ZACNQ401N2 412 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGKV3-25-201ENST00000523155 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms