RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 SOBPA7XYQ1 873 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 SLFN14P0C7P3 912 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 CTHP32929 405 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 CYP2J2P51589 502 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 TSSK4Q6SA08 328 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-203ENST00000511587 PTPRDP23468 1912 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 KINO60870 393 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 LILRB5O75023 590 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ATP2C2O75185 946 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 LMO2P25791 158 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 PLCB2Q00722 1185 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 SYT15Q9BQS2 421 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CDH9Q9ULB4 789 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CCL26Q9Y258 94 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TNNI1P19237 187 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MAGEA11P43364 429 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TNK2Q07912 1038 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 GAS6Q14393 721 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TXNDC8Q6A555 127 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MON1AQ86VX9 555 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF516Q92618 1163 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 FNBP1Q96RU3 617 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 NME7Q9Y5B8 376 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 GREB1Q4ZG55 1949 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF292O60281 2723 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 AVPR1AP37288 418 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TTC8Q8TAM2 541 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 RIN3Q8TB24 985 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MYLPFQ96A32 169 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 PAGE5Q96GU1 130 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 HPSEQ9Y251 543 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TACC1O75410 805 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 PFKFB1P16118 471 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 STK4Q13043 487 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TDP1Q9NUW8 608 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 FAM163BP0C2L3 166 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CMA1P23946 247 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CCR3P51677 355 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 LRRC32Q14392 662 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 RUBCNQ92622 972 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 MMS19Q96T76 1030 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 EPC1Q9H2F5 836 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 HPS4Q9NQG7 708 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.22■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 EXOC3O60645 756 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 CCINQ13939 588 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 VSTM1Q6UX27 236 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.21■■□□□ 1.47
ZBED3-203ENST00000511587 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms