RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 FCARP24071 287 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXL6Q8N531 539 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 NELFBQ8WX92 580 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SMARCD2Q92925 531 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PCED1BQ96HM7 432 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ASB16Q96NS5 453 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR88Q9GZN0 384 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 IL21Q9HBE4 155 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 WDFY4Q6ZS81 3184 aa18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 STX10O60499 249 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRN2O75325 713 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ECI2O75521 394 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 BDNFP23560 247 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGEA11P43364 429 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GPC5P78333 572 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 KRT39Q6A163 491 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TTI2Q6NXR4 508 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.01■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC38A8A6NNN8 435 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CSH1P0DML2 217 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CSH2P0DML3 217 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ASPAP45381 313 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 MXI1P50539 228 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR158Q5T848 1215 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 VSTM1Q6UX27 236 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SIX5Q8N196 739 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIML1Q8N9V2 468 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SEMA4DQ92854 862 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP63Q96MT8 703 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 WNT16Q9UBV4 365 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CA14Q9ULX7 337 aa18■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 NOL4O94818 638 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CDC25CP30307 473 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIK1P39086 918 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 VIPR2P41587 438 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 STX17P56962 302 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 NLRP12P59046 1061 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP4F8P98187 520 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CBWD6Q4V339 395 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC150Q8NCX0 1101 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXL13Q8NEE6 735 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GCNAQ96QF7 691 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 B3GNT5Q9BYG0 378 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 BCO2Q9BYV7 579 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 MFSD1Q9H3U5 465 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TRPV4Q9HBA0 871 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 RAB20Q9NX57 234 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF318Q5VUA4 2279 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 BICDL2A1A5D9 508 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 KRBA1A5PL33 1030 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CLDN5O00501 218 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 F11P03951 625 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 NDST1P52848 882 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 VCPP55072 806 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 PAK1Q13153 545 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ORC1Q13415 861 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GRM2Q14416 872 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FOXR2Q6PJQ5 311 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 VITQ6UXI7 678 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FRMD5Q7Z6J6 570 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM150AQ86TG1 271 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ACOT1Q86TX2 421 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC35C1Q96A29 364 aa17.98■□□□□ 0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms