RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 NRLP54845 237 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SPEM2Q0P670 501 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SMARCB1Q12824 385 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 CCINQ13939 588 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.56□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 CBWD2Q8IUF1 395 aa13.56□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.56□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM191BP0C7N4 346 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 CSH2P0DML3 217 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 PLCB2Q00722 1185 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R5DQ14738 602 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 E2F4Q16254 413 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 ADGRF2Q8IZF7 708 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 DHX58Q96C10 678 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A12Q96S37 553 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 DGKKQ5KSL6 1271 aa13.54□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 INTS13Q9NVM9 706 aa13.54□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.54□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 RAB23Q9ULC3 237 aa13.54□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 PTPRDP23468 1912 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQ27 194 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQ64 194 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQD8 194 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 C2orf78A6NCI8 922 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 NOL4O94818 638 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SHC4Q6S5L8 630 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 MON1AQ86VX9 555 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 TOP6BLQ8N6T0 577 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HPDLQ96IR7 371 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 TRIM9Q9C026 710 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 TNMDQ9H2S6 317 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ABCB6Q9NP58 842 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 NME7Q9Y5B8 376 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SPTBN2O15020 2390 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.52□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZNF233A6NK53 670 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CLIC2O15247 247 aa13.52□□□□□ -0.25
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