RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PDGFRBP09619 1106 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ATF6P18850 670 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ANXA13P27216 316 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 AVPR2P30518 371 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PPP3CCP48454 512 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PPP3CAQ08209 521 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 WDR44Q5JSH3 913 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TMC8Q8IU68 726 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MLKLQ8NB16 471 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 NELFBQ8WX92 580 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MYRFLQ96LU7 910 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PTPRDP23468 1912 aa14.23□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 P4HA2O15460 535 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TRIM49P0CI25 452 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TRIM49CP0CI26 452 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CEBPBP17676 345 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PFKLP17858 780 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CYP2F1P24903 491 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 GABRR2P28476 465 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PDE6CP51160 858 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CYP27A1Q02318 531 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TCF15Q12870 199 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CAMK4Q16566 473 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ISM2Q6H9L7 571 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TTI2Q6NXR4 508 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PARM1Q6UWI2 310 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ING5Q8WYH8 240 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 FGF14Q92915 247 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PCED1BQ96HM7 432 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 SHDQ96IW2 340 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 C8orf48Q96LL4 319 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ASB16Q96NS5 453 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 BCO2Q9BYV7 579 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TASP1Q9H6P5 420 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 RAB20Q9NX57 234 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 OBP2AQ9NY56 170 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 DACH1Q9UI36 760 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.22□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PRU2 124 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 BIN1O00499 593 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 NOL4O94818 638 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CCDC192P0DO97 292 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 BMP6P22004 513 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 GRIK1P39086 918 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CCR2P41597 374 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 INCA1Q0VD86 236 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 GAREM2Q75VX8 874 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MYLPFQ96A32 169 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.21□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CACNA1HO95180 2353 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 DPYSL4O14531 572 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ATP2C2O75185 946 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MOSPD3O75425 235 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SOAT2O75908 522 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PSMC3P17980 439 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 BDNFP23560 247 aa14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms