RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 NCANO14594 1321 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PATJQ8NI35 1801 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP2C2O75185 946 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOL4O94818 638 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 NLRP12P59046 1061 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP4F8P98187 520 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 VSTM1Q6UX27 236 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYRFLQ96LU7 910 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 OBP2AQ9NY56 170 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 NME7Q9Y5B8 376 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOBPA7XYQ1 873 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 AKAP3O75969 853 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMC2O95347 1197 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 VNN1O95497 513 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 GDI1P31150 447 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 VAMP7P51809 220 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDR2Q16832 855 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA20Q8TB22 786 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF4BQ92750 862 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCED1BQ96HM7 432 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 FOXQ1Q9C009 403 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CACNA1HO95180 2353 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARNTLO00327 626 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF263O14978 683 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLSTN1O94985 981 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 F11P03951 625 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDGFRBP09619 1106 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 P4HA1P13674 534 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP27A1Q02318 531 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SV2AQ7L0J3 742 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 STKLD1Q8NE28 680 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA17Q96L03 361 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 A8MXQ7 604 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 H0Y858 1186 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPYSL4O14531 572 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM66O15016 1216 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHADO15335 359 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRAMEF12O95522 483 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRT13P13646 458 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIK3CAP42336 1068 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAM9Q13443 819 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 YAF2Q8IY57 180 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCE1Q969G3 411 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 TADA3O75528 432 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 BDNFP23560 247 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANXA13P27216 316 aa20.1■□□□□ 0.81
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