RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449182.1

PTPRZ1-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 4,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-202ENST00000449182 NUDT7P0C024 238 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 GALP22466 123 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 USP11P51784 963 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 BRD7Q9NPI1 651 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 HTRA1Q92743 480 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 ACOD1A6NK06 481 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRZ1-202ENST00000449182 CPA1P15085 419 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 SOX6P35712 828 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 HAAOP46952 286 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 CA9Q16790 459 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 KLHL12Q53G59 568 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRZ1-202ENST00000449182 SSX9Q7RTT3 188 aa6.93□□□□□ -1.3
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