RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDC25CP30307 473 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TNNC1P63316 161 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TNK2Q07912 1038 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FZD5Q13467 585 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DPH6Q7L8W6 267 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DNASE1L2Q92874 299 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IRF7Q92985 503 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDH9Q9ULB4 789 aa15.2■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PIEZO1Q92508 2521 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARNTLO00327 626 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLDN5O00501 218 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PDXKO00764 312 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TADA3O75528 432 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCNE1P24864 410 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NBL1P41271 181 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CACNA2D1P54289 1103 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ORC1Q13415 861 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PNOCQ13519 176 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TSSK4Q6SA08 328 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RIN3Q8TB24 985 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAM3CQ92520 227 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PCED1BQ96HM7 432 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BCO2Q9BYV7 579 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SDCBP2Q9H190 292 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.19■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A8MXQ7 604 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NOL4O94818 638 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RHOBTB3O94955 611 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SP9P0CG40 484 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CSH1P0DML2 217 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CSH2P0DML3 217 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GRIK1P39086 918 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 USP46P62068 366 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NCOA4Q13772 614 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF699Q32M78 642 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC22A12Q96S37 553 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABCB6Q9NP58 842 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANK1P16157 1881 aa15.18■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TSC2P49815 1807 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHADO15335 359 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TACC1O75410 805 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AKAP3O75969 853 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MYL1P05976 194 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRIM49P0CI25 452 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRIM49CP0CI26 452 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AVPR1AP37288 418 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SPATA18Q8TC71 538 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 E2F7Q96AV8 911 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GKN1Q9NS71 199 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.17■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C2orf78A6NCI8 922 aa15.16■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 F8VP50 259 aa15.16■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAN2B1O00754 1011 aa15.16■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NR2F2P24468 414 aa15.16■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GCLMP48507 274 aa15.16■□□□□ 0.02
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLDN10P78369 228 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms