RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430889.2

HOXC4-202, Transcript of homeobox C4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC4, Length 1,666 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4-202ENST00000430889 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 C5orf60A6NFR6 353 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 RASGRF2O14827 1237 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 F2P00734 622 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ITGAVP06756 1048 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ADCY8P40145 1251 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CORO7P57737 925 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ADAM17P78536 824 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ACAP1Q15027 740 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PKDCCQ504Y2 493 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MORN1Q5T089 497 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF365Q70YC5 407 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TTC39CQ8N584 583 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KAT2BQ92831 832 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SNX27Q96L92 541 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GGA2Q9UJY4 613 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 M0QYV0 167 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MYO1CO00159 1063 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 EBAG9O00559 213 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NDST1P52848 882 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KAZNQ674X7 775 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TRNP1Q6NT89 227 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 BBS12Q6ZW61 710 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CCDC25Q86WR0 208 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PWWP2AQ96N64 755 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SERPINB12Q96P63 405 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SETD4Q9NVD3 440 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 EURLQ9NYK6 297 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NME7Q9Y5B8 376 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 LRRD1A4D1F6 860 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GMNCA6NCL1 334 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ENDOD1O94919 500 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KRT7P08729 469 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 HIC1Q14526 733 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KIZQ2M2Z5 673 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ODF2Q5BJF6 829 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 EMC1Q8N766 993 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KIF12Q96FN5 646 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TLDC2A0PJX2 215 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 HAS3O00219 553 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PPEF2O14830 753 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NPTXRO95502 500 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ACSL3O95573 720 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 IGHA2P01877 340 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ABHD2P08910 425 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KDELR1P24390 212 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PCK1P35558 622 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 VPS41P49754 854 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ARSEP51690 589 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CDC42EP1Q00587 391 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 P3H1Q32P28 736 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MDM1Q8TC05 714 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GJD2Q9UKL4 321 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NRCAMQ92823 1304 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 E7EVH7 732 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms