RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 CUL2Q13617 745 aa25.39■■□□□ 1.66
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UBE2E3-202ENST00000410062 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
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UBE2E3-202ENST00000410062 ITFG1Q8TB96 612 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3-202ENST00000410062 WHAMMQ8TF30 809 aa25.39■■□□□ 1.66
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UBE2E3-202ENST00000410062 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.39■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.39■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 GCNT4Q9P109 453 aa25.39■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 VEPH1Q14D04 833 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 C12orf29Q8N999 325 aa25.38■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.38■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 ASB3Q9Y575 518 aa25.38■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 MYL4P12829 197 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 CCR2P41597 374 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGEA11P43364 429 aa25.37■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 VWA3BQ502W6 1294 aa25.37■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 ITIH5Q86UX2 942 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.37■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.37■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 VSTM1Q6UX27 236 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 RRAGAQ7L523 313 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 TMC8Q8IU68 726 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 TAF12Q16514 161 aa25.35■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 TTC39CQ8N584 583 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 FGF13Q92913 245 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 GJA1P17302 382 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 CEBPBP17676 345 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC9A1P19634 815 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.35■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 FUKQ8N0W3 1084 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 LIMD1Q9UGP4 676 aa25.35■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF197O14709 1029 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD23BP54727 409 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 APBA1Q02410 837 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT31Q15323 416 aa25.34■■□□□ 1.65
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UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3-202ENST00000410062 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.34■■□□□ 1.65
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