RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 FUKQ8N0W3 1084 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.03■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GJB6O95452 261 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ALDH1A1P00352 501 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 GJC1P36383 396 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 IFNAR2P48551 515 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 HADHQ16836 314 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TFAP2BQ92481 460 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 CFAP73A6NFT4 308 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 HBP1O60381 514 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 LY6KQ17RY6 165 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.02■■□□□ 1.6
PMS1-205ENST00000409985 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.592e-7■■■□□ 15.6
PMS1-205ENST00000409985 FAM187BQ17R55 369 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 KAZNQ674X7 775 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CENPUQ71F23 418 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 C9orf72Q96LT7 481 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.01■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TCP11X1B4DZS4 312 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 KRT3P12035 628 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TCF4P15884 667 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ATICP31939 592 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 KYAT1Q16773 422 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 BBS12Q6ZW61 710 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CYP4X1Q8N118 509 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CYP3A43Q9HB55 503 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 LRRD1A4D1F6 860 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CHUKO15111 745 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CREB1P16220 341 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TSHRP16473 764 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 STX2P32856 288 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 GPS1Q13098 491 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 WDR72Q3MJ13 1102 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ZNF667Q5HYK9 610 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SCARA3Q6AZY7 606 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CCDC62Q6P9F0 684 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CYB5D1Q6P9G0 228 aa25■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PWWP2AQ96N64 755 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 HAUS2Q9NVX0 235 aa25■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ANK1P16157 1881 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 MAGEB2O15479 319 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 GABRB2P47870 512 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 IL9RQ01113 521 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TNFAIP2Q03169 654 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 MPP2Q14168 576 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.99■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.99■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.98■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 PSMA2P25787 234 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ACVR2BQ13705 512 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TTC39CQ8N584 583 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 FGD4Q96M96 766 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 RASA4BC9J798 803 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 RASA4O43374 803 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CBLBQ13191 982 aa24.98■■□□□ 1.59
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