RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 CD274Q9NZQ7 290 aa4.3□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 C9J4A7 227 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 KLHL18O94889 574 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 HIST1H2ABP04908 130 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CLUP10909 449 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 GNA15P30679 374 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 TAF6P49848 677 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 AP2B1P63010 937 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 PCSK7Q16549 785 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 LIX1Q8N485 282 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 DEFB123Q8N688 67 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 USP7Q93009 1102 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 E9PMD0 336 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ADORA2AP29274 412 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ERVK-9P63128 1117 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ERVK-24P63145 666 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 TAP1Q03518 808 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.728e-7■■■■■ 66.2
CENPF-201ENST00000366955 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 USP38Q8NB14 1042 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CYP39A1Q9NYL5 469 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CPS1P31327 1500 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 URADA6NGE7 173 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 AOC2O75106 756 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CIAO1O76071 339 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 IL18RAPO95256 599 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ADH1CP00326 375 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 C6P13671 934 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 PLS3P13797 630 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CDH8P55286 799 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 EOGTQ5NDL2 527 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 C11orf88Q6PI97 169 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 LDAHQ9H6V9 325 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 A6NNZ2 444 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ZBTB5O15062 677 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 SLC16A4O15374 487 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 AVILO75366 819 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CARTPTQ16568 116 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 PADI6Q6TGC4 694 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 DYNLL2Q96FJ2 89 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 BFARQ9NZS9 450 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 MCF2P10911 925 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 MTHFRP42898 656 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 BACE1P56817 501 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 NFIAQ12857 509 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 KRT71Q3SY84 523 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CACUL1Q86Y37 369 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 LGMNQ99538 433 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 THEGQ9P2T0 379 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 INSL6Q9Y581 213 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ZNF202O95125 648 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 ELNP15502 786 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 IGFALSP35858 605 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 RFC5P40937 340 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 RANBP1P43487 201 aa4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CENPF-201ENST00000366955 CXCL9Q07325 125 aa4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms