RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTN3A1O00481 513 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 EBLN1P0CF75 366 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR2F6P10588 404 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2C9P11712 490 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNB3P54284 484 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT3P56703 355 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT17Q04695 432 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB32Q13637 225 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMPR2Q13873 1038 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LLGL1Q15334 1064 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKS1AQ92625 1134 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFKQ969G6 155 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 COX11Q9Y6N1 276 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 A6NNZ2 444 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX3O15119 743 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRS3O43559 492 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D4O60343 1298 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLR5O60602 858 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1RP00736 705 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV2-14P01704 120 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELFN1P0C7U0 828 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRAFP15056 766 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATF3P18847 181 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPD1P21695 349 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRPAP1P30533 357 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLCN2P51788 898 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTBP1Q13363 440 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 E2F2Q14209 437 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM153CQ494X1 144 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOA5Q6Q788 366 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SARAFQ96BY9 339 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUCLG2Q96I99 432 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMP4Q99727 224 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPH1Q9BZG8 443 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DKK3Q9UBP4 350 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 L1RE1Q9UN81 338 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KAT6AQ92794 2004 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM233B4DJY2 109 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO1FO00160 1098 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPP1O14773 563 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFB7P17568 137 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRD4P21917 467 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCSK6P29122 969 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCT8P50990 548 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO1EQ12965 1108 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBX1Q14549 363 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRM3Q14832 879 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAVSQ7Z434 540 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 C14orf80Q86SX3 495 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DTX2Q86UW9 622 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF575Q86XF7 245 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAML1Q92585 1016 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAPLN3Q96S86 360 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLOD4Q9HC38 313 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK32BQ9NY57 414 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms