RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GPR158Q5T848 1215 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DPH6Q7L8W6 267 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF516Q92618 1163 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 IRF7Q92985 503 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 E2F7Q96AV8 911 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 F5P12259 2224 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.19□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 LRRN2O75325 713 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF12O95522 483 aa8.19□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.19□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 SNX25Q9H3E2 840 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TASP1Q9H6P5 420 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.19□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CDH9Q9ULB4 789 aa8.19□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.19□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 ARNTLO00327 626 aa8.18□□□□□ -1.1
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SGMS1-201ENST00000361543 TACC1O75410 805 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GABBR2O75899 941 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NOL4O94818 638 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PDGFRBP09619 1106 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CSH1P0DML2 217 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CSH2P0DML3 217 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GLULP15104 373 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PTMSP20962 102 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NR2F2P24468 414 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 WEE1P30291 646 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 AVPR1AP37288 418 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP12P59046 1061 aa8.18□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DLG4P78352 724 aa8.18□□□□□ -1.1
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