RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 BDNFP23560 247 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 VEPH1Q14D04 833 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 SCN4BQ8IWT1 228 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 LEMD2Q8NC56 503 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TWNKQ96RR1 684 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 KXD1Q9BQD3 176 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM30AQ9NV96 361 aa28.79■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN5O00501 218 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 MICAL2O94851 1124 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FCARP24071 287 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 GABRR2P28476 465 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CACNA2D1P54289 1103 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 DPCR1Q3MIW9 517 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf50Q6ZRC1 276 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FRMD5Q7Z6J6 570 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ITIH5Q86UX2 942 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 IMPG2Q9BZV3 1241 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 NIF3L1Q9GZT8 377 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 RAB20Q9NX57 234 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.78■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM221A6NGB7 291 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 M0R296 226 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 STX10O60499 249 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 P4HA1P13674 534 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 NDST1P52848 882 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 CYP4F8P98187 520 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FAM78AQ5JUQ0 283 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 FBXL13Q8NEE6 735 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 B3GNT5Q9BYG0 378 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 GDE1Q9NZC3 331 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 RWDD2AQ9UIY3 292 aa28.77■■■□□ 2.2
TPGS1-201ENST00000359315 NCANO14594 1321 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEA11P43364 429 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM150AQ86TG1 271 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 ACOT1Q86TX2 421 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 ARID3AQ99856 593 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 ATXN3LQ9H3M9 355 aa28.76■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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TPGS1-201ENST00000359315 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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TPGS1-201ENST00000359315 MLKLQ8NB16 471 aa28.75■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 TATDN2Q93075 761 aa28.75■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 COQ4Q9Y3A0 265 aa28.75■■■□□ 2.19
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TPGS1-201ENST00000359315 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.74■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 MTSS1LQ765P7 747 aa28.74■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM59Q8IWR1 403 aa28.74■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 WHAMMQ8TF30 809 aa28.74■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 NXPE3Q969Y0 559 aa28.74■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 ASB16Q96NS5 453 aa28.74■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 PRR33A8MZF0 331 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA6L22H0YM25 854 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 TADA3O75528 432 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 NOL4O94818 638 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC130P13994 396 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 INCA1Q0VD86 236 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 TAF12Q16514 161 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 FAM35AQ86V20 835 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 GPIHBP1Q8IV16 184 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.73■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 F8VP50 259 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 F11P03951 625 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CFHP08603 1231 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CSH1P0DML2 217 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CSH2P0DML3 217 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 GRIK1P39086 918 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 VIPR2P41587 438 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 MARSP56192 900 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
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TPGS1-201ENST00000359315 VSTM1Q6UX27 236 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf29Q8N999 325 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC150Q8NCX0 1101 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 RSPRY1Q96DX4 576 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CYP3A43Q9HB55 503 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 FAM49BQ9NUQ9 324 aa28.72■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 CILPO75339 1184 aa28.71■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 SRFP11831 508 aa28.71■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 USP46P62068 366 aa28.71■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 GPC5P78333 572 aa28.71■■■□□ 2.19
TPGS1-201ENST00000359315 LRMPQ12912 555 aa28.71■■■□□ 2.19
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