RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 ADM5C9JUS6 153 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 EFNA5P52803 228 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 MTM1Q13496 603 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ERICH1Q86X53 443 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ELP3Q9H9T3 547 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CHKBQ9Y259 395 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 GJB1P08034 283 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 GPX6P59796 221 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 MOGSQ13724 837 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 24.7
PTDSS2-201ENST00000308020 SETDB1Q15047 1291 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PDK4Q16654 411 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 HIF1AQ16665 826 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 VSIG1Q86XK7 387 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR49Q8IV35 697 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ZWILCHQ9H900 591 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SIP14410 1827 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPRFP10586 1907 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PRKCBP05771 671 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPN7P35236 360 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 GDF10P55107 478 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 MAPK6Q16659 721 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SENP1Q9P0U3 644 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TYROBPO43914 113 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CCND1P24385 295 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SSTR1P30872 391 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 IER5Q5VY09 327 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM237Q96Q45 408 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CLUHO75153 1309 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 FGFR1P11362 822 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT4P19013 534 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC18A1P54219 525 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TFDP1Q14186 410 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 MSS51Q4VC12 460 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 HHATQ5VTY9 493 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ACTL9Q8TC94 416 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 GPR20Q99678 358 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TRPC3Q13507 836 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 NLRP4Q96MN2 994 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 HAO1Q9UJM8 370 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 OGTO15294 1046 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 PSMA2P25787 234 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM167AQ96KS9 214 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS2-201ENST00000308020 CST8O60676 142 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms