RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 SERPING1P05155 500 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 FAM163BP0C2L3 166 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CPB1P15086 417 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ARPP19P56211 112 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ROR1Q01973 937 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ELF2Q15723 593 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 EXOC3L4Q17RC7 722 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LLGL2Q6P1M3 1020 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 OSTM1Q86WC4 334 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PALB2Q86YC2 1186 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 EFHBQ8N7U6 833 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LMO3Q8TAP4 145 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NT5C1BQ96P26 610 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 RTP3Q9BQQ7 232 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SDCBP2Q9H190 292 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GUCA1BQ9UMX6 200 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NCK2O43639 380 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 AKR1B10O60218 316 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 WEE2P0C1S8 567 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PCSK1P29120 753 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 KIF11P52732 1056 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CDH8P55286 799 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TSPY1Q01534 308 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 RAB33AQ14088 237 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 OR6B3Q8NGW1 331 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TATDN2Q93075 761 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM209Q96SK2 561 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ARID3AQ99856 593 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ACBD6Q9BR61 282 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 AIPL1Q9NZN9 384 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PTPRDP23468 1912 aa12.69□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 WDR27A2RRH5 827 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 A8MXQ7 604 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LINC01565O15544 149 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TGM5O43548 720 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 HCRTO43612 131 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ABL1P00519 1130 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 OR4Q2P0C623 313 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SRGAP2BP0DMP2 458 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 EPCAMP16422 314 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CD58P19256 250 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CUL2Q13617 745 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 EP400NLQ6ZTU2 488 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PPM1KQ8N3J5 372 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SYT15Q9BQS2 421 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GANQ9H2C0 597 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CLDND1Q9NY35 253 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 V9GYY5 206 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PJA2O43164 708 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GLP2RO95838 553 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 C1RP00736 705 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PDGFRBP09619 1106 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA31D3P0C874 917 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SLC9A1P19634 815 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LMO2P25791 158 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PON1P27169 355 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NDST1P52848 882 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 INCA1Q0VD86 236 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GPR17Q13304 367 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ADAM15Q13444 863 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 KCNC3Q14003 757 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 COL19A1Q14993 1142 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TPGS2Q68CL5 300 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 HGSNATQ68CP4 663 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LILRA6Q6PI73 481 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGEF19Q8IW93 802 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GOLGA1Q92805 767 aa12.67□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CASP10Q92851 521 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms