RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 NLRP12P59046 1061 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 DLG4P78352 724 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 CYP4F8P98187 520 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ZACNQ401N2 412 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 GCNAQ96QF7 691 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 SLC46A2Q9BY10 475 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 LTB4R2Q9NPC1 389 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 COL4A2P08572 1712 aa23.78■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 IKBKBO14920 756 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 VNN1O95497 513 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 TNNC1P63316 161 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ENPEPQ07075 957 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 NCOA4Q13772 614 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 TAF12Q16514 161 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 VSTM1Q6UX27 236 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 TPRG1Q6ZUI0 275 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 MYLPFQ96A32 169 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PRADC1-201ENST00000258083 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PROB1E7EW31 1015 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF263O14978 683 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 CHADO15335 359 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 LRRN2O75325 713 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PRAMEF12O95522 483 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PDGFRBP09619 1106 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 NBL1P41271 181 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 BIRC3Q13489 604 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 ANGPT1Q15389 498 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 STKLD1Q8NE28 680 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SPATA20Q8TB22 786 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 CLDN23Q96B33 292 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PCED1BQ96HM7 432 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 NELL2Q99435 816 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.76■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PHACTR2O75167 634 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 TADA3O75528 432 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 AKAP3O75969 853 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 CD72P21854 359 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 NR2F2P24468 414 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 FZD5Q13467 585 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PNOCQ13519 176 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 CEP135Q66GS9 1140 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SV2AQ7L0J3 742 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SPATA17Q96L03 361 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SNX25Q9H3E2 840 aa23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 FAM170BA6NMN3 283 aa23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF699Q32M78 642 aa23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MON1AQ86VX9 555 aa23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 TIGD1Q96MW7 591 aa23.74■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MAN2B1O00754 1011 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 BDNFP23560 247 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MAGEA9P43362 315 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 TAF4BQ92750 862 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 GSDMAQ96QA5 445 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.73■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 VAMP7P51809 220 aa23.72■■□□□ 1.39
PRADC1-201ENST00000258083 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms