RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.21	□□□□□ -0.45
FAM200B-223	ENST00000622362	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		12.21	□□□□□ -0.45
FAM200B-223	ENST00000622362	BBOX1	O75936	387 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ERVK-9	P63128	1117 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TRADD	Q15628	312 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	FKBP6	O75344	327 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF23	P17027	643 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	STMN3	Q9NZ72	180 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PAK5	Q9P286	719 aa		12.21	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	MEGF6	O75095	1541 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TRAPPC3	O43617	180 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K6	O95382	1288 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ADORA2B	P29275	332 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	RGS7	P49802	495 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	STX5	Q13190	355 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	UGP2	Q16851	508 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ABI1	Q8IZP0	508 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PIGB	Q92521	554 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	SPON2	Q9BUD6	331 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP27B1	O15528	508 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	HUS1	O60921	280 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	RIN3	Q8TB24	985 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TLR10	Q9BXR5	811 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMC5	P62195	406 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	FIGN	Q5HY92	759 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	DCAF4	Q8WV16	495 aa		12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF839	A8K0R7	811 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362		A8MXQ7	604 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	USP1	O94782	785 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	CENPC	Q03188	943 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	IRGC	Q6NXR0	463 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	MTERF3	Q96E29	417 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	OMA1	Q96E52	524 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	OPLAH	O14841	1288 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	THRA	P10827	490 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	HMOX2	P30519	316 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PLIN5	Q00G26	463 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	EPHA7	Q15375	998 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	ARMCX1	Q9P291	453 aa		12.19	□□□□□ -0.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.19	□□□□□ -0.46

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