RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606828.2

MED16-211, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-211ENST00000606828 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 KRT13P13646 458 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GJA1P17302 382 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 LMO2P25791 158 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 AVPR2P30518 371 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CLCN5P51795 746 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 VAMP7P51809 220 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GPC5P78333 572 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PFKPQ01813 784 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZNF699Q32M78 642 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 FAM171BQ6P995 826 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 POTEHQ6S545 545 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 FLCNQ8NFG4 579 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GIPC2Q8TF65 315 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ASB16Q96NS5 453 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GCNAQ96QF7 691 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PKMYT1Q99640 499 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PRRX2Q99811 253 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 SYT15Q9BQS2 421 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.64□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 HCRTO43612 131 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PDGFRBP09619 1106 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 P4HA1P13674 534 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 RFX1P22670 979 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CYP2F1P24903 491 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GABRR2P28476 465 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CDC25CP30307 473 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PRCPP42785 496 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ENPEPQ07075 957 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZACNQ401N2 412 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GAREM2Q75VX8 874 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 SV2AQ7L0J3 742 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 TAF4BQ92750 862 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 TSG101Q99816 390 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CA14Q9ULX7 337 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.63□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 STK25O00506 426 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CETN3O15182 167 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ATP2C2O75185 946 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CSH1P0DML2 217 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CSH2P0DML3 217 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 FCARP24071 287 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 MAGEA11P43364 429 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 NUBP1P53384 320 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 DDR2Q16832 855 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 MYLPFQ96A32 169 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 E2F7Q96AV8 911 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 SHDQ96IW2 340 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 NOTCH4Q99466 2003 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 KRBA1A5PL33 1030 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 A8MXQ7 604 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 VNN1O95497 513 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 NPR3P17342 541 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PSMC3P17980 439 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GPR15P49685 360 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CYP27A1Q02318 531 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 STIM1Q13586 685 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 CCDC142Q17RM4 750 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 GPR158Q5T848 1215 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 IER5LQ5T953 404 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 VSTM1Q6UX27 236 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 ADSSL1Q8N142 457 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 PCED1BQ96HM7 432 aa14.61□□□□□ -0.07
MED16-211ENST00000606828 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms