RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		23.42	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	EPHB6	O15197	1021 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	WEE2	P0C1S8	567 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	ADAM15	Q13444	863 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	SPC24	Q8NBT2	197 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	ACBD6	Q9BR61	282 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	STK33	Q9BYT3	514 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	CLDND1	Q9NY35	253 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	23.41	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	NCK2	O43639	380 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	GYPC	P04921	128 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	LMO2	P25791	158 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	LILRA6	Q6PI73	481 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	CASP10	Q92851	521 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	ARID3A	Q99856	593 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		23.4	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	REV3L	O60673	3130 aa		23.39	■■□□□ 1.34
LTBP4-227	ENST00000600026	TBX10	O75333	385 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	ABLIM3	O94929	683 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	C1R	P00736	705 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	SPATA31D3	P0C874	917 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PCSK1	P29120	753 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CASP14	P31944	242 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	ZBED6	P86452	979 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	TSPY1	Q01534	308 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	GPR17	Q13304	367 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	KAT5	Q92993	513 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	SYT15	Q9BQS2	421 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	MYO6	Q9UM54	1294 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PTPRD	P23468	1912 aa		23.39	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026		A8MXQ7	604 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PDGFRB	P09619	1106 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CD58	P19256	250 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	STAT1	P42224	750 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	INCA1	Q0VD86	236 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	TPGS2	Q68CL5	300 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CNGA4	Q8IV77	575 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PKMYT1	Q99640	499 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CDH9	Q9ULB4	789 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		23.38	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	MTMR11	A4FU01	709 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	VNN2	O95498	520 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	LTBR	P36941	435 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC142	Q17RM4	750 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	SHC3	Q92529	594 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CISH	Q9NSE2	258 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		23.37	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	ATP2C2	O75185	946 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	KRT5	P13647	590 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	KRT9	P35527	623 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	USP8	P40818	1118 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	NDST1	P52848	882 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	JAM2	P57087	298 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	ADCY1	Q08828	1119 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	UBR7	Q8N806	425 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	BAP1	Q92560	729 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	TWNK	Q96RR1	684 aa		23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	23.36	■■□□□ 1.33
LTBP4-227	ENST00000600026	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		23.36	■■□□□ 1.33

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