RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SCTRP47872 440 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 PTP4A2Q12974 167 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MPP2Q14168 576 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 HOOK3Q86VS8 718 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SULF1Q8IWU6 871 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TWNKQ96RR1 684 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MAF1Q9H063 256 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 RNF8O76064 485 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ATG7O95352 703 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 NFICP08651 508 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MAPK6Q16659 721 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CYP1B1Q16678 543 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ZNF699Q32M78 642 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 UBA3Q8TBC4 463 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 EVPLQ92817 2033 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SPAG7O75391 227 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ZNF286BP0CG31 522 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 RARGP13631 454 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SLFN12LQ6IEE8 588 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ANKMY2Q8IV38 441 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SOCS7O14512 581 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TOM1L1O75674 476 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 RTP1P59025 263 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MFN1Q8IWA4 741 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 GPR20Q99678 358 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MAFO75444 373 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 NUDT17P0C025 328 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 HSPA6P17066 643 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CLDN10P78369 228 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 PPP2R5EQ16537 467 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CHST13Q8NET6 341 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SNF8Q96H20 258 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 GPR25O00155 361 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ATP2A1O14983 1001 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 GPS1Q13098 491 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DBN1Q16643 649 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 CDO1Q16878 200 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 METTL7BQ6UX53 244 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 FGD4Q96M96 766 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 SYNCQ9H7C4 482 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 TMEM120BA0PK00 339 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K13O43283 966 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 FAM189A1O60320 539 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 GAS8O95995 478 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ITGB3P05106 788 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 IMPDH2P12268 514 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 DRD4P21917 467 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 MMP8P22894 467 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ARSEP51690 589 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 BPIFB4P59827 614 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-205ENST00000587860 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms