RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLCO2A1Q92959 643 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITIH4Q14624 930 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF410Q86VK4 478 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SGSM3Q96HU1 749 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AAASQ9NRG9 546 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADPGKQ9BRR6 497 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FSCN2O14926 492 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP2C2O75185 946 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GJB6O95452 261 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ECEL1O95672 775 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F2P00734 622 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC91Q7Z6B0 441 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GUA9 196 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDH8P55286 799 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTP4A2Q12974 167 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAMLD1Q13495 774 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNGA2Q16280 664 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM228AQ86W67 206 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TFAP2BQ92481 460 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VCPIP1Q96JH7 1222 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASB7Q9H672 318 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LLGL1Q15334 1064 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGMBQ6NW40 437 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C17orf99Q6UX52 265 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKS4BQ8N8V4 417 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACAP3Q96P50 834 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WHRNQ9P202 907 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD19P15391 556 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ORC1Q13415 861 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MFSD10Q14728 455 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KYAT1Q16773 422 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC38Q502W7 563 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFNL1Q8IU54 200 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OSMRQ99650 979 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCINQ9Y6U3 715 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRCAMQ92823 1304 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP2C9P11712 490 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMP8P22894 467 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R7Q15435 360 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC25Q86WR0 208 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXorf38Q8TB03 319 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SDCBP2Q9H190 292 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PROSCO94903 275 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPTXRO95502 500 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC1A1P43005 524 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BEX3Q00994 111 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT17Q04695 432 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALCOCO2Q13137 446 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNCBQ16143 134 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP6NLQ92738 828 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCO2Q9BYV7 579 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR32O75388 356 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYL3P08590 195 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIC1Q14526 733 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARVAQ9NVD7 372 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IVDP26440 423 aa25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms