RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577202.1

DRC3-208, Transcript of dynein regulatory complex subunit 3, human

TSL 5

Gene DRC3, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DRC3-208	ENST00000577202	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	BMPR1A	P36894	532 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	BCAT1	P54687	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	DSG1	Q02413	1049 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CNGA2	Q16280	664 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CHP1	Q99653	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202		M0QYV0	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202		O00370	1275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MYBL1	P10243	752 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PBX3	P40426	434 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PSMD5	Q16401	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PLXNA3	P51805	1871 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202		F8W810	466 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	RTN2	O75298	545 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MICAL2	O94851	1124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CA3	P07451	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MME	P08473	750 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CTSA	P10619	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CPB1	P15086	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	LMO2	P25791	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ERVK-21	P61565	698 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	FMO1	Q01740	532 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CENPC	Q03188	943 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	RTP2	Q5QGT7	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DRC3-208	ENST00000577202	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms