RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-215ENST00000576106 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 POTEHQ6S545 545 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 FLCNQ8NFG4 579 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 GIPC2Q8TF65 315 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CA14Q9ULX7 337 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MYO10Q9HD67 2058 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 KRT13P13646 458 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 RFX1P22670 979 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 LMO2P25791 158 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 GABRR2P28476 465 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 VAMP7P51809 220 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 NUBP1P53384 320 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 DLG4P78352 724 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF699Q32M78 642 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 FAM171BQ6P995 826 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 SPATA20Q8TB22 786 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 GCNAQ96QF7 691 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TSC2P49815 1807 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 HCRTO43612 131 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 AKAP3O75969 853 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PDGFRBP09619 1106 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 FCARP24071 287 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CYP2F1P24903 491 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CDC25CP30307 473 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ENPEPQ07075 957 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZACNQ401N2 412 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 GAREM2Q75VX8 874 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 E2F7Q96AV8 911 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TCHHQ07283 1943 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 KRBA1A5PL33 1030 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 STK25O00506 426 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CSH1P0DML2 217 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CSH2P0DML3 217 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 P4HA1P13674 534 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 NPR3P17342 541 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PRCPP42785 496 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 IER5LQ5T953 404 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 SV2AQ7L0J3 742 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TAF4BQ92750 862 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 FAM122AQ96E09 287 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 SHDQ96IW2 340 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TSG101Q99816 390 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa24.42■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CETN3O15182 167 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ATP2C2O75185 946 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MAGEA11P43364 429 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 VNN1O95497 513 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 AOC1P19801 751 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PLA2G5P39877 138 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 GPR15P49685 360 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 DDR2Q16832 855 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CCDC142Q17RM4 750 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 GPR158Q5T848 1215 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 TMEM105Q8N8V8 129 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MYLPFQ96A32 169 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAP1-215ENST00000576106 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms