RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 SLFN14P0C7P3 912 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 TNNI1P19237 187 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 PCSK1P29120 753 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 DPH6Q7L8W6 267 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 FNBP1Q96RU3 617 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 IL21Q9HBE4 155 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 R4GN57 208 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 NCANO14594 1321 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CHADO15335 359 aa24.11■■□□□ 1.45
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CLN3-232ENST00000568443 CYP4F8P98187 520 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 OSTM1Q86WC4 334 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 ABCB6Q9NP58 842 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 FAM186AA6NE01 2351 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CFAP54Q96N23 3096 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SHISA7A6NL88 538 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 GABRDO14764 452 aa24.1■■□□□ 1.45
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CLN3-232ENST00000568443 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 FAM3CQ92520 227 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SPATA32Q96LK8 384 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 OBP2AQ9NY56 170 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CSH1P0DML2 217 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CSH2P0DML3 217 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CMA1P23946 247 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CYP2F1P24903 491 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 WEE1P30291 646 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 GPR15P49685 360 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CYP24A1Q07973 514 aa24.09■■□□□ 1.45
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CLN3-232ENST00000568443 PSMD6Q15008 389 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 DDR2Q16832 855 aa24.09■■□□□ 1.45
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CLN3-232ENST00000568443 PAGE5Q96GU1 130 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 MMS19Q96T76 1030 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 PKMYT1Q99640 499 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 CGRRF1Q99675 332 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.09■■□□□ 1.45
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CLN3-232ENST00000568443 A0A1B0GVL5 298 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 ARNTLO00327 626 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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CLN3-232ENST00000568443 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 NLRP12P59046 1061 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 KRT85P78386 507 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 EXOC1Q9NV70 894 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 USP25Q9UHP3 1055 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-232ENST00000568443 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 HCRTO43612 131 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 EXOC3O60645 756 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 PRAMEF12O95522 483 aa24.07■■□□□ 1.44
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CLN3-232ENST00000568443 CCNE1P24864 410 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 LMO2P25791 158 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 PSMD2Q13200 908 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 ADSSL1Q8N142 457 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-232ENST00000568443 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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