RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 SLFN14P0C7P3 912 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 TNNI1P19237 187 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 PCSK1P29120 753 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 DPH6Q7L8W6 267 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 FNBP1Q96RU3 617 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 IL21Q9HBE4 155 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 R4GN57 208 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 NCANO14594 1321 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CHADO15335 359 aa24.11■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 OSTM1Q86WC4 334 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 ABCB6Q9NP58 842 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 FAM186AA6NE01 2351 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CFAP54Q96N23 3096 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 SHISA7A6NL88 538 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 GABRDO14764 452 aa24.1■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 SPATA32Q96LK8 384 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 OBP2AQ9NY56 170 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CSH1P0DML2 217 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CSH2P0DML3 217 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CMA1P23946 247 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CYP2F1P24903 491 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 WEE1P30291 646 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 GPR15P49685 360 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CYP24A1Q07973 514 aa24.09■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 DDR2Q16832 855 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 PAGE5Q96GU1 130 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 MMS19Q96T76 1030 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 PKMYT1Q99640 499 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 CGRRF1Q99675 332 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.09■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 ARNTLO00327 626 aa24.08■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 NLRP12P59046 1061 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 KRT85P78386 507 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.08■■□□□ 1.45
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CLN3-215ENST00000565236 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 EXOC1Q9NV70 894 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 USP25Q9UHP3 1055 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN3-215ENST00000565236 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 HCRTO43612 131 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 EXOC3O60645 756 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 PRAMEF12O95522 483 aa24.07■■□□□ 1.44
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CLN3-215ENST00000565236 CCNE1P24864 410 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 LMO2P25791 158 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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CLN3-215ENST00000565236 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 ADSSL1Q8N142 457 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CLN3-215ENST00000565236 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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