RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF516Q92618 1163 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 GPR88Q9GZN0 384 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SNX25Q9H3E2 840 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.51■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MYBPHLA2RUH7 354 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DPYSL4O14531 572 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ATP2C2O75185 946 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 LRRN2O75325 713 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF202O95125 648 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 NR3C1P04150 777 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PSMC3P17980 439 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 LMO2P25791 158 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 NUCB2P80303 420 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SYT15Q9BQS2 421 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DOCK8Q8NF50 2099 aa15.5■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ANK1P16157 1881 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 FAM170BA6NMN3 283 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF263O14978 683 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CDC25CP30307 473 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 STARD6P59095 220 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MYL6P60660 151 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CYP27A1Q02318 531 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PRKCQQ04759 706 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DPYDQ12882 1025 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DPH6Q7L8W6 267 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PJA1Q8NG27 643 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SCN1AP35498 2009 aa15.49■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PDXKO00764 312 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 GABRDO14764 452 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 KIF20AO95235 890 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 WARSP23381 471 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ANGPT1Q15389 498 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TTC16Q8NEE8 873 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TTC8Q8TAM2 541 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SPATA18Q8TC71 538 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 IRF7Q92985 503 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 MYLPFQ96A32 169 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PKMYT1Q99640 499 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TASP1Q9H6P5 420 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 IL21Q9HBE4 155 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CDH9Q9ULB4 789 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 NOTCH4Q99466 2003 aa15.48■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 NCANO14594 1321 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 RHOBTB3O94955 611 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CSH1P0DML2 217 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CSH2P0DML3 217 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 GRIK1P39086 918 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DLG4P78352 724 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PNOCQ13519 176 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF699Q32M78 642 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 DNASE1L2Q92874 299 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 E2F7Q96AV8 911 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 BCO2Q9BYV7 579 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 ABCB6Q9NP58 842 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.47■□□□□ 0.07
HECTD4-212ENST00000550724 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms