RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.8□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GMNCA6NCL1 334 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 SMIM23A6NLE4 172 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 TTC4O95801 387 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 CETPP11597 493 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 CDKN2BP42772 138 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 KYAT1Q16773 422 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 KAZNQ674X7 775 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 RELL1Q8IUW5 271 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 MDM1Q8TC05 714 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ACSL3O95573 720 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ERBB2P04626 1255 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 KRT3P12035 628 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 SLCO1A2P46721 670 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 LMNB2Q03252 620 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 XYLT1Q86Y38 959 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 BBOF1Q8ND07 529 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 PWWP2AQ96N64 755 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 C2CD2Q9Y426 696 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 A0A1B0GUA9 196 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 LRCH4O75427 683 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 SMPD1P17405 629 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 PSMA2P25787 234 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GABRB2P47870 512 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GRB14Q14449 540 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GRIK4Q16099 956 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 CCL15Q16663 113 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 NLRP7Q8WX94 980 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 LRRD1A4D1F6 860 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 MICAL2O94851 1124 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 MMP3P08254 477 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 IL1R2P27930 398 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GTF2A2P52657 109 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 INCA1Q0VD86 236 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 LONRF1Q17RB8 773 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 GPR142Q7Z601 462 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ALLCQ8N6M5 410 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 HPDLQ96IR7 371 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 MAML3Q96JK9 1138 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 FAM107BQ9H098 131 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.77□□□□□ -0.04
LIMK1-208ENST00000538333 SCN1AP35498 2009 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 C5orf60A6NFR6 353 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 CHN1P15882 459 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GPD2P43304 727 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 TAZQ16635 292 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 KYNUQ16719 465 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 SERPINB12Q96P63 405 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 GGA2Q9UJY4 613 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMK1-208ENST00000538333 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms