RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 TCF25Q9BQ70 676 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 FSCN2O14926 492 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GNA15P30679 374 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ERVFC1P60507 584 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 STILQ15468 1287 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF677Q86XU0 584 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP2C2O75185 946 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SERPING1P05155 500 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE6CP51160 858 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ARID5AQ03989 594 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ORC1Q13415 861 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SGO2Q562F6 1265 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 C12orf29Q8N999 325 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 SYT11Q9BT88 431 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 ACP6Q9NPH0 428 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-205ENST00000528462 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 C2CD2LO14523 706 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR17Q13304 367 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CNGA2Q16280 664 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 TFAP2BQ92481 460 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF576Q9H609 170 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CERS4Q9HA82 394 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 O00370 1275 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCL14O95715 111 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM209Q96SK2 561 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 MYO9BQ13459 2157 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 MED7O43513 233 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 C1RP00736 705 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CD19P15391 556 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ANXA13P27216 316 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 NDUFV1P49821 464 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CDR2Q01850 454 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB33AQ14088 237 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 LCLAT1Q6UWP7 414 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 PCED1BQ96HM7 432 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 MYO7AQ13402 2215 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 EPOPA6NHQ4 379 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 TEX28O15482 410 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 THAP12O43422 761 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 OR1D2P34982 312 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ROR1Q01973 937 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 TPGS2Q68CL5 300 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 FUKQ8N0W3 1084 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ABCB6Q9NP58 842 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 MAFFQ9ULX9 164 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAM12O43184 909 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 LPXNO60711 386 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ABLIM3O94929 683 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-205ENST00000528462 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.35■■□□□ 1.33
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