RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	TTLL1	O95922	423 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	VIPR2	P41587	438 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SOX10	P56693	466 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MLC1	Q15049	377 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	FBXO41	Q8TF61	875 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PBK	Q96KB5	322 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	OVOL3	O00110	214 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TBC1D4	O60343	1298 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TLR5	O60602	858 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAJB5	O75953	348 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ALDH9A1	P49189	494 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	BMPR2	Q13873	1038 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPNT	Q6UXI9	565 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SUCLG2	Q96I99	432 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	XPR1	Q9UBH6	696 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSPAN6	O43657	245 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD38	P28907	300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRPAP1	P30533	357 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAPK10	P53779	464 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	CACNB3	P54284	484 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	E2F2	Q14209	437 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TBCC	Q15814	346 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TXNRD1	Q16881	649 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	RUNDC1	Q96C34	613 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	UROC1	Q96N76	676 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	HAPLN3	Q96S86	360 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	CFAP69	A5D8W1	941 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ADM5	C9JUS6	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ONECUT2	O95948	504 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	C1R	P00736	705 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPD1	P21695	349 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36	1e-11	■■■□□ 17.6
NCKAP1-208	ENST00000495619	WNT3	P56703	355 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB32	Q13637	225 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRRC41	Q15345	812 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	BTN3A1	O00481	513 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR2F6	P10588	404 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIT	P10721	976 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	NDUFB7	P17568	137 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC7A1	P30825	629 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC11A2	P49281	568 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	UCP3	P55916	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	LILRA4	P59901	499 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRT17	Q04695	432 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	DTX2	Q86UW9	622 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TIMP4	Q99727	224 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR27	A2RRH5	827 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	PROP1	O75360	226 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NCKAP1-208	ENST00000495619	MYB	P10242	640 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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