RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 PSMD6Q15008 389 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PKMYT1Q99640 499 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 EXOC1Q9NV70 894 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ZNF263O14978 683 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CYP2F1P24903 491 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 LMO2P25791 158 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 DDR2Q16832 855 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 E2F7Q96AV8 911 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CGRRF1Q99675 332 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 BCO2Q9BYV7 579 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TCHHQ07283 1943 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 EXOC3O60645 756 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ATP2C2O75185 946 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PCSK1P29120 753 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CDC25CP30307 473 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NDUFA8P51970 172 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 DPH6Q7L8W6 267 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 YAF2Q8IY57 180 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SPATA18Q8TC71 538 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ZNF516Q92618 1163 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MMS19Q96T76 1030 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NELL2Q99435 816 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TASP1Q9H6P5 420 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 USP25Q9UHP3 1055 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 USP34Q70CQ2 3546 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ARNTLO00327 626 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 DPYSL4O14531 572 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PRAMEF12O95522 483 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SYKP43405 635 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CASP4P49662 377 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PSMD2Q13200 908 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 GCNAQ96QF7 691 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ABCB6Q9NP58 842 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PRR23AA6NEV1 266 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 F11P03951 625 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PDGFRBP09619 1106 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PRR29P0C7W0 189 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SP9P0CG40 484 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NLRP12P59046 1061 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FZD5Q13467 585 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FAM171BQ6P995 826 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CLDN23Q96B33 292 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SYT15Q9BQS2 421 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MAN2B1O00754 1011 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CHADO15335 359 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CSH1P0DML2 217 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CSH2P0DML3 217 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FSIP1Q8NA03 581 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TTC8Q8TAM2 541 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FAM3CQ92520 227 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms