RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PTPN7P35236 360 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 DLK2Q6UY11 383 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 B4GALT5O43286 388 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 IL9RQ01113 521 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KRT15P19012 456 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ORC1Q13415 861 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CENPUQ71F23 418 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TRABD2AQ86V40 505 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.55■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MGRN1O60291 552 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 NR1H3Q13133 447 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GPR20Q99678 358 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SYNCQ9H7C4 482 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 BANF1O75531 89 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PGK2P07205 417 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 FOXN2P32314 431 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 FAM228AQ86W67 206 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.54■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 LRCH4O75427 683 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CXCL8P10145 99 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TAC1P20366 129 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 IL1R2P27930 398 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CDH8P55286 799 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CGB2Q6NT52 195 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CEP57Q86XR8 500 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 EMC1Q8N766 993 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ACTL9Q8TC94 416 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TRABDQ9H4I3 376 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ECT2Q9H8V3 914 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PPME1Q9Y570 386 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MED7O43513 233 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CST8O60676 142 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TMEM192Q8IY95 271 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.53■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CFAP73A6NFT4 308 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ACKR2O00590 384 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ALOX15BO15296 676 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 B4GALT4O60513 344 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KRT7P08729 469 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PROZP22891 400 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GDF10P55107 478 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MTFR1Q15390 333 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 HIF1AQ16665 826 aa21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TDRPQ86YL5 185 aa21.52■■□□□ 1.04
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