RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458295.5

SH3BGR-209, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SH3BGR, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGR-209ENST00000458295 ZNF560Q96MR9 790 aa14.55□□□□□ -0.08
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SH3BGR-209ENST00000458295 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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SH3BGR-209ENST00000458295 TMEM206Q9H813 350 aa14.53□□□□□ -0.08
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SH3BGR-209ENST00000458295 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.52□□□□□ -0.09
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SH3BGR-209ENST00000458295 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.52□□□□□ -0.09
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SH3BGR-209ENST00000458295 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 DPYSL4O14531 572 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 SPTLC2O15270 562 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 LMO2P25791 158 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 NRLP54845 237 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BGR-209ENST00000458295 TSPY1Q01534 308 aa14.51□□□□□ -0.09
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