RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TMC2Q8TDI7 906 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GIPC2Q8TF65 315 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SMARCD2Q92925 531 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TIGD1Q96MW7 591 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PI4K2AQ9BTU6 479 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GPR88Q9GZN0 384 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZFP14Q9HCL3 533 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ABCB6Q9NP58 842 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FBXL21Q9UKT6 434 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 CA14Q9ULX7 337 aa13.01□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 IKBKBO14920 756 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PDGFRBP09619 1106 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GABRR2P28476 465 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 WEE1P30291 646 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ATICP31939 592 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 AP3M2P53677 418 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TSPY1Q01534 308 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 NHLH1Q02575 133 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 DDR2Q16832 855 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 WDR72Q3MJ13 1102 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZACNQ401N2 412 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 COBLL1Q53SF7 1204 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 VITQ6UXI7 678 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SV2AQ7L0J3 742 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ITIH5Q86UX2 942 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FLCNQ8NFG4 579 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ELMO3Q96BJ8 720 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM122AQ96E09 287 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GSDMAQ96QA5 445 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC46A2Q9BY10 475 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 CDH9Q9ULB4 789 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 KMT2EQ8IZD2 1858 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ARNTLO00327 626 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 KIF20AO95235 890 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PCSK1P29120 753 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PRCPP42785 496 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 CDH8P55286 799 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ADAM9Q13443 819 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 CEP135Q66GS9 1140 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 STKLD1Q8NE28 680 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MYRFLQ96LU7 910 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MMS19Q96T76 1030 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PRRX2Q99811 253 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SYT15Q9BQS2 421 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 SDCBP2Q9H190 292 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ATXN3LQ9H3M9 355 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 DPEP3Q9H4B8 488 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 HEPACAM2A8MVW5 462 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 NOL4O94818 638 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FGF19O95750 216 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GLULP15104 373 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PSMC3P17980 439 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 NR2F2P24468 414 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MAGEA11P43364 429 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 VAMP7P51809 220 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PMS1P54277 932 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 NLRP12P59046 1061 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ENPEPQ07075 957 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PPP3CAQ08209 521 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 FZD5Q13467 585 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TRPC3Q13507 836 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 NCOA4Q13772 614 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 GRM2Q14416 872 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 EDRF1Q3B7T1 1238 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MFSD6LQ8IWD5 586 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PCED1BQ96HM7 432 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 PHOX2BQ99453 314 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TASP1Q9H6P5 420 aa12.98□□□□□ -0.33
RPSAP46-201ENST00000428316 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms